More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03380 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03380  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  100 
 
 		 153 aa  296  6e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  60.98 
 
 		 204 aa  141  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.72 
 
 		 201 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.28 
 
 		 201 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  52 
 
 		 197 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 201 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  39.84 
 
 		 200 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 206 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 200 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.54 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 200 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 200 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 200 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 200 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  37.4 
 
 		 200 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 200 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 200 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  50.79 
 
 		 197 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 200 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.64 
 
 		 200 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48 
 
 		 200 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 200 aa  104  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.08 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  37.4 
 
 		 200 aa  104  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  45.9 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.08 
 
 		 202 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.28 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 200 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  46.34 
 
 		 204 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.05 
 
 		 224 aa  98.2  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.8 
 
 		 223 aa  97.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3028  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 225 aa  97.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  decreased coverage  0.0000266978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.08 
 
 		 201 aa  97.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  38.84 
 
 		 205 aa  97.8  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 202 aa  97.4  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.72 
 
 		 203 aa  96.7  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 201 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 241 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.28 
 
 		 201 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.58 
 
 		 219 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 220 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.16 
 
 		 201 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 201 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.41 
 
 		 204 aa  94.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 205 aa  94.4  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.16 
 
 		 200 aa  94  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  42.15 
 
 		 217 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 212 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 205 aa  93.2  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 204 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 221 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 218 aa  92.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 220 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.16 
 
 		 201 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 215 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 216 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 215 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  42.5 
 
 		 221 aa  92  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 211 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 		 200 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 219 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.8 
 
 		 209 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 222 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.83 
 
 		 221 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 201 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 212 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 216 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 		 224 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 202 aa  90.5  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 201 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 		 219 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2393  response regulator receiver  41.94 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820012  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 225 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.72 
 
 		 201 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.83 
 
 		 215 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 201 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.11 
 
 		 190 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 213 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 242 aa  87.8  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4449  two component LuxR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 230 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.98 
 
 		 233 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 221 aa  87  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 216 aa  87  9e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.34 
 
 		 208 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 224 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 234 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  41.13 
 
 		 216 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 220 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.4 
 
 		 217 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 214 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 221 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.67 
 
 		 226 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.71 
 
 		 212 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 210 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  37.41 
 
 		 230 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  42.37 
 
 		 221 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>