More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1553 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  100 
 
 		 136 aa  264  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  100 
 
 		 136 aa  264  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  99.26 
 
 		 136 aa  260  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  92.65 
 
 		 136 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  58.46 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  53.73 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  54.81 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  54.81 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  54.81 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  57.6 
 
 		 138 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50 
 
 		 403 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  58.14 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  56.59 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  49.26 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1218  response regulator receiver  33.09 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  29.92 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  29.92 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  31.2 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  34.23 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  34.82 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  31.5 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  32.46 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  29.37 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  31.15 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  30.33 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  30.33 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  28.68 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.67 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  30.33 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  30.33 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  30.33 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  30.33 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  30.33 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  31.15 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  28 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17330  Two-component response regulator, LuxR family  30.51 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.46 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  30.33 
 
 		 214 aa  57  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 218 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  30.71 
 
 		 214 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  31.5 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4452  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421397  normal  0.0817611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  35.82 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  30.71 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  30.08 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  29.92 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  29.51 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  27.87 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  31.5 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  32.62 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1561  LuxR family DNA-binding response regulator  24.6 
 
 		 226 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0012725  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  37.5 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  29.92 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  25.2 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.31 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1992  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108622  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 227 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  29.51 
 
 		 214 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  26.87 
 
 		 306 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 215 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2089  two component LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 220 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.954326  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2393  response regulator receiver  30.99 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820012  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2177  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 220 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.430622  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3499  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  41.76 
 
 		 218 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03380  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.52 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 215 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>