More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0475 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  100 
 
 		 143 aa  281  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  49.17 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  45.74 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  41.41 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  40.5 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  39.67 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.4 
 
 		 737 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  44.8 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  44.72 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  37.72 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  38.6 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  37.72 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  37.72 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4742  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.81 
 
 		 403 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  34.68 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  27.87 
 
 		 288 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2537  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.01 
 
 		 242 aa  57  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  30.47 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000781929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.82 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.03 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  31.2 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  27.27 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  27.27 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  27.27 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  27.27 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0897  response regulator receiver domain-containing protein  31.5 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0703  two component LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  27.27 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  27.27 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1382  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  27.12 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  27.64 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2439  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.67 
 
 		 369 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0681  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 639 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.657626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 489 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  26.45 
 
 		 276 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  26.45 
 
 		 276 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.5 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  30.09 
 
 		 264 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 913 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 212 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0870  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.19 
 
 		 360 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  26.83 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  26.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  26.89 
 
 		 257 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  26.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  29.82 
 
 		 281 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  31.67 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  26.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0607  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000161034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2366  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 385 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000342445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  26.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>