255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3994 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  100 
 
 		 146 aa  303  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0607  response regulator receiver domain-containing protein  66.4 
 
 		 129 aa  179  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000161034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  58.47 
 
 		 131 aa  153  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  58.26 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  51.82 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  53.28 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  52.89 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  53.72 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  50.75 
 
 		 137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  52.99 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  47.06 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  47.06 
 
 		 139 aa  120  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  52.21 
 
 		 123 aa  113  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4742  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5997  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  34.55 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5989  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  35.19 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  29.69 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  37.04 
 
 		 252 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  37.04 
 
 		 223 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  37.04 
 
 		 287 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  37.04 
 
 		 252 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  37.04 
 
 		 252 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  37.04 
 
 		 252 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  37.04 
 
 		 267 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  28.7 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  28.7 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3273  two component Fis family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0475  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 453 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  32.86 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0574  two component transcriptional regulator, Fis family  30.28 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0360  response regulator receiver domain-containing protein  31.19 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0692819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.96 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0059  two component Fis family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 225 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.04 
 
 		 225 aa  47.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30.28 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0170  two component Fis family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.485216  normal  0.727058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1518  PrrA (RegA), response regulator involved in oxygen regulation of photosynthesis genes  29.63 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0131  response regulator receiver  29.36 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0306  two component Fis family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 184 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.0618542 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  31.48 
 
 		 222 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4041  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.631958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  33.75 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7660  two-component transcriptional regulator RegR  27.27 
 
 		 224 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3611  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194602  normal  0.24428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2387  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 510 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3581  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 490 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2959  two component Fis family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11120  Response regulator, sigma54-dependent regulatory protein; AlgB  27.83 
 
 		 448 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2690  two component Fis family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2440  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 375 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.627522 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.57 
 
 		 470 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4317  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0275462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0618  response regulator receiver protein  26.81 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3989  two component transcriptional regulator, Fis family  27.34 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3601  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4650  two component Fis family transcriptional regulator  35 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3743  two component LuxR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 225 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 222 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.63 
 
 		 224 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0671  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 457 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1179  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 457 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.655382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  28.32 
 
 		 682 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0812  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 453 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  hitchhiker  0.00000328811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1522  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.45 
 
 		 461 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3916  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  24.48 
 
 		 462 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000203856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3430  photosynthetic apparatus regulatory protein RegA  26.89 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  28.18 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  25.89 
 
 		 230 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 508 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334907 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0745  two-component regulator  23.85 
 
 		 223 aa  44.3  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.802142  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3325  two component Fis family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0552341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  31.48 
 
 		 224 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  25.89 
 
 		 230 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>