More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1507 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  100 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  76.98 
 
 		 149 aa  217  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  76.26 
 
 		 142 aa  214  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  40.5 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  38.71 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  35.59 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  35.59 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  38.24 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  31.75 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 403 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  37.1 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 136 aa  57  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  32.73 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.44 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0699  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  27.43 
 
 		 246 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  29.36 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 935 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.91 
 
 		 209 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0332  C4-dicarboxylate transport response regulator transcription regulator protein  30.08 
 
 		 438 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 1791 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1967  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03380  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  28.83 
 
 		 661 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  25.2 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  23.14 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.83 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  30.95 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  30.56 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 242 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  24.59 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.42 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  22.31 
 
 		 222 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  30.56 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.25 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 454 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 242 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.5 
 
 		 737 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.26 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  27.83 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 262 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 		 201 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  22.83 
 
 		 497 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 878 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  28.1 
 
 		 1287 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 221 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 863 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  32.74 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.05 
 
 		 941 aa  47.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  31.08 
 
 		 209 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 262 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.83 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  23.77 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1105  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 475 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926771  normal  0.835973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2637  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0573022  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4742  response regulator receiver domain-containing protein  28.46 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  23.77 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.69 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 781 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  26.85 
 
 		 265 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3211  two component AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 548 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.2 
 
 		 937 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 392 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  26.89 
 
 		 244 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.03 
 
 		 1245 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 235 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  26.96 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 947 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  26.85 
 
 		 265 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  29.66 
 
 		 785 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  29.66 
 
 		 785 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>