89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0607 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0607  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 129 aa  268  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000161034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  66.4 
 
 		 146 aa  179  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  55.12 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  57.38 
 
 		 136 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  57.14 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  58.12 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  59.83 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  53.49 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  53.66 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  56.78 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  50.41 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  47.37 
 
 		 132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  48.28 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4742  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5997  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 149 aa  57  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  34.55 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5989  response regulator receiver protein  38.96 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  31.19 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  31.19 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0993  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.250481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.97 
 
 		 209 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1914  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 815 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.979442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  31.82 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  33.01 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2070  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.7 
 
 		 459 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  38.03 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.68 
 
 		 352 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0445779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3601  response regulator receiver protein  25.2 
 
 		 224 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0741  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.289134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  31.82 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0131  DNA-binding response regulator  25.62 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00417692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0137  DNA-binding response regulator  25.62 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  28.32 
 
 		 272 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4317  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0275462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.63 
 
 		 737 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3989  two component transcriptional regulator, Fis family  31.52 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1989  response regulator receiver protein  34.18 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3611  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194602  normal  0.24428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0702  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 460 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0671  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 457 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7660  two-component transcriptional regulator RegR  25.2 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0231  response regulator receiver domain-containing protein  26.83 
 
 		 184 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3273  two component Fis family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 194 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  33.73 
 
 		 258 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2343  two component transcriptional regulator, Fis family  28.95 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 248 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0150  two component Fis family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1992  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108622  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0963  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  25.95 
 
 		 467 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2255  two component transcriptional regulator, Fis family  28.95 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1607  two component Fis family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.016434  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0111  helix-turn-helix, Fis-type  27.68 
 
 		 184 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0286945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0360  response regulator receiver domain-containing protein  25.2 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0692819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 		 403 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  31.15 
 
 		 222 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.039666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4341  two component LuxR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 343 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0353  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.2 
 
 		 220 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6108  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  38.24 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  29.11 
 
 		 224 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1179  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 457 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.655382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1275  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 472 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0891685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1905  response regulator receiver domain-containing protein  31.73 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.558841  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.08 
 
 		 225 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 523 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1129  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.75 
 
 		 453 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>