279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2455 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 156 aa  321  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  72.95 
 
 		 131 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  65.65 
 
 		 136 aa  186  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  64.89 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  65.65 
 
 		 132 aa  183  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  68.85 
 
 		 131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  64.75 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  65 
 
 		 153 aa  167  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  61.54 
 
 		 136 aa  161  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  53.97 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  52.89 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  57.26 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0607  response regulator receiver domain-containing protein  53.66 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000161034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  53.39 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  53.39 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4742  response regulator receiver domain-containing protein  44 
 
 		 133 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  46.03 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  33.58 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  30.51 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5997  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  35.94 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  32.06 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.58 
 
 		 737 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  31.01 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  31.01 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  28.07 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  28.23 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5989  response regulator receiver protein  36.25 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  28.07 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  29.73 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3611  response regulator receiver protein  25.18 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194602  normal  0.24428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  29.73 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  29.73 
 
 		 136 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.32 
 
 		 403 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  30.7 
 
 		 209 aa  51.6  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0590  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.34 
 
 		 440 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  30.16 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.46 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  26.67 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3743  two component LuxR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 229 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.59 
 
 		 242 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2748  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.78 
 
 		 542 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0293  two component LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0720  DNA-binding response regulator  29.36 
 
 		 229 aa  47.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 209 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.95 
 
 		 222 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0800  response regulator receiver  29.41 
 
 		 224 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.271408  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  27.27 
 
 		 228 aa  47.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.35 
 
 		 438 aa  47.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 221 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 245 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.8 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  30.59 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 235 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.96 
 
 		 234 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 222 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  29.73 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  29.59 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.07 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2810  response regulator receiver protein  22.31 
 
 		 299 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  29.76 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0475  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 453 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  33.75 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1595  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.1 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.356259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2256  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4432  two component transcriptional regulator  23.31 
 
 		 222 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  29.17 
 
 		 233 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  27.72 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4933  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.52 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.742602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 242 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.83 
 
 		 236 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  23.48 
 
 		 214 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  30.23 
 
 		 208 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0094  two component LuxR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 222 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>