More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2810 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2810  response regulator receiver protein  100 
 
 		 299 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1472  response regulator receiver protein  68.87 
 
 		 302 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1670  response regulator  39.34 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1803  response regulator  39.34 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1850  response regulator  39.34 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000105934 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1875  response regulator  39.67 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1668  response regulator receiver protein  39.41 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1617  response regulator  39.34 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1924  response regulator  39.34 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1652  response regulator  39.34 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3527  response regulator  39.34 
 
 		 310 aa  221  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1814  response regulator  39.67 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2855  response regulator  38.26 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3169  response regulator  37.62 
 
 		 314 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.956214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2929  response regulator  37.3 
 
 		 314 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0681879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3153  response regulator  37.3 
 
 		 314 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3140  response regulator  38.26 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2099  response regulator  37.3 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2905  response regulator  37.94 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000873207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3162  response regulator  37.94 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.456471 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2128  response regulator  29.05 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0424  response regulator receiver protein  22.64 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.97 
 
 		 634 aa  73.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  29.11 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  31.55 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  26.25 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  31.06 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 121 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  33.56 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  33.56 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.82 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  31.9 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.19 
 
 		 227 aa  62.4  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 1066 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.48 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  32.5 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  25.62 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  25.68 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.46 
 
 		 941 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4117  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.167574 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  30.08 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3727  two component LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4860  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.142587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52250  two-component response regulator  30 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.220903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 1096 aa  58.9  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  32.87 
 
 		 513 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4718  sigma-54 dependent response regulator  26.55 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.05 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3721  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.43 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 123 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  29.24 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  29.24 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2672  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.62 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665859  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4581  two-component response regulator  29.17 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2501  response regulator  32.77 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0251325  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  30 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1598  response regulator receiver domain-containing protein  28.95 
 
 		 120 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0917565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0838  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  31.62 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.11 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  31.88 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.71 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  30.46 
 
 		 238 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 537 aa  57  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  28.07 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0897  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 695 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  33.08 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  29.27 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.48 
 
 		 463 aa  56.2  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3873  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 476 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3966  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 476 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4076  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 460 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.311151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  28 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.3 
 
 		 900 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1575  response regulator of RpoS  29.09 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.307447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  29.77 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  30.51 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  30.46 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>