More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4581 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4581  two-component response regulator  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52250  two-component response regulator  91.14 
 
 		 239 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.220903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1253  two component transcriptional regulator  58.51 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  hitchhiker  0.000294124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1213  two component transcriptional regulator  59.07 
 
 		 252 aa  274  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4221  two component transcriptional regulator  57.2 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.430301  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4066  two component transcriptional regulator  58.09 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.945155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1651  winged helix family two component transcriptional regulator  57.68 
 
 		 272 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.514526  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1731  two component transcriptional regulator  57.38 
 
 		 236 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37050  Two-component response regulator  59.48 
 
 		 233 aa  244  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3962  two-component response regulator PfeR  55.36 
 
 		 240 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0585  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 230 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0579  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0568  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0534  winged helix family two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3920  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0794  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.665518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3411  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3534  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  37.78 
 
 		 219 aa  158  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  41.15 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  41.15 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.33 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.2 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06112  transcriptional regulatory protein CpxR  36.8 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  41.33 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  35.29 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2046  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.095715  hitchhiker  0.000000000691151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  38.1 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.22 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  36.36 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  41.15 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2301  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4562  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0982939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2050  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2416  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134995  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2426  DNA-binding response regulator  36.16 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  36.36 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  37.89 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 236 aa  148  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 227 aa  148  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  37.66 
 
 		 232 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14310  Response regulator  38.86 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  39.73 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  34.63 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  35.87 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  38.43 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3929  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.91 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.91 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.91 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.91 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  32.61 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.91 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.91 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1718  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0955826  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  35.84 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  32.61 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03764  two-component system regulatory protein  38.66 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  32.9 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  32.9 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.91 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  37.39 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  32.9 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  32.9 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  32.9 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.19 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1562  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.91 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.279171  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.91 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.91 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.91 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.91 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  34.91 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1936  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0482001  normal  0.0104585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>