More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37050 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_37050  Two-component response regulator  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246304  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1731  two component transcriptional regulator  64.44 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1253  two component transcriptional regulator  61.9 
 
 		 253 aa  267  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  hitchhiker  0.000294124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4581  two-component response regulator  59.48 
 
 		 239 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1213  two component transcriptional regulator  61.88 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1651  winged helix family two component transcriptional regulator  60.17 
 
 		 272 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.514526  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4066  two component transcriptional regulator  60.53 
 
 		 253 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.945155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52250  two-component response regulator  58.87 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.220903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4221  two component transcriptional regulator  59.47 
 
 		 240 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.430301  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0579  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0534  winged helix family two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3962  two-component response regulator PfeR  53.12 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0585  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0568  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0794  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.665518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3411  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3920  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3534  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920223  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06112  transcriptional regulatory protein CpxR  41.41 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 227 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  41.3 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1718  response regulator receiver protein  41.36 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0955826  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  43.44 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 222 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  41.48 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  38.56 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  40.87 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0261  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000361731  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000851  probable transcriptional regulator SyrB  38.81 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00675785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0367  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000100212  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  42.86 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0256  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000272342  decreased coverage  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4477  transcriptional regulatory protein CpxR  46.43 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  42.86 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0261  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000347248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0252  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000571082  hitchhiker  0.000346333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3769  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000556998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0253  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2924  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  40.09 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0254  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000326652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2301  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06763  transcriptional regulatory protein CpxR  39.64 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2050  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2046  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.095715  hitchhiker  0.000000000691151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2416  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134995  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  40.62 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  40.09 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  39.01 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.29 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 225 aa  148  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  38.22 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2294  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000876575  normal  0.575243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 226 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.04 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2426  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.04 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.04 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.45 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  40.87 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1138  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.22 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.22 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.04 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2799  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  33.92 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>