More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3534 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3534  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920223  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0794  two component transcriptional regulator  58.22 
 
 		 232 aa  264  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.665518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3411  two component transcriptional regulator  55.8 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06112  transcriptional regulatory protein CpxR  54.39 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3920  two component transcriptional regulator  54.91 
 
 		 232 aa  234  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1731  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1253  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  hitchhiker  0.000294124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1213  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 252 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3962  two-component response regulator PfeR  44.54 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1651  winged helix family two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.514526  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4066  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.945155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0579  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4221  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.430301  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4581  two-component response regulator  42.79 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52250  two-component response regulator  42.98 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.220903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0568  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0585  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.69 
 
 		 228 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0534  winged helix family two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  44.2 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37050  Two-component response regulator  46.7 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246304  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  43.5 
 
 		 228 aa  167  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.41 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.41 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000851  probable transcriptional regulator SyrB  40.62 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00675785  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06763  transcriptional regulatory protein CpxR  40.62 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  39.19 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4132  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.11 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0084  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.11 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.601085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0081  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.11 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 230 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  40.97 
 
 		 232 aa  158  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.29 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  38.77 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.29 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.29 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.29 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.29 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  37.5 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  38.74 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  41.85 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.85 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.85 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.85 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.85 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.85 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  41.85 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.85 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2301  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  37.5 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 239 aa  154  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 239 aa  154  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2050  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  40.09 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  37.5 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0254  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000326652  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  34.08 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2046  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.095715  hitchhiker  0.000000000691151 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0261  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000361731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  37.28 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4477  transcriptional regulatory protein CpxR  44.44 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0358  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0252  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000571082  hitchhiker  0.000346333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3769  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000556998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0253  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0261  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000347248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4810  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.41 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0256  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000272342  decreased coverage  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2416  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134995  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.93 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  40.97 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0367  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000100212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.22 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  38.59 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1718  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0955826  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>