More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3962 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3962  two-component response regulator PfeR  100 
 
 		 240 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0585  two component transcriptional regulator  71.56 
 
 		 230 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0579  two component transcriptional regulator  70.35 
 
 		 230 aa  314  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0568  two component transcriptional regulator  69.33 
 
 		 230 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0534  winged helix family two component transcriptional regulator  69.33 
 
 		 230 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1213  two component transcriptional regulator  55.9 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1253  two component transcriptional regulator  55.95 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  hitchhiker  0.000294124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1731  two component transcriptional regulator  52.59 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4066  two component transcriptional regulator  55.95 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.945155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1651  winged helix family two component transcriptional regulator  55.51 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.514526  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4581  two-component response regulator  55.36 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4221  two component transcriptional regulator  52.59 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.430301  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52250  two-component response regulator  53.91 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.220903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37050  Two-component response regulator  53.12 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246304  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0794  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 232 aa  185  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.665518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3411  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06112  transcriptional regulatory protein CpxR  40.71 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3534  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920223  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1718  response regulator receiver protein  40.64 
 
 		 224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0955826  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3920  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  42.29 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2294  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000876575  normal  0.575243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  41.41 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  41.33 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2426  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  37.07 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  37.22 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  39.91 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  37.22 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  39.47 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.11 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1936  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0482001  normal  0.0104585 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2046  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.095715  hitchhiker  0.000000000691151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2301  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2074  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00164535  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2050  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1941  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1904  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00970528  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  36.44 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  37.44 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  37.39 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0016  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  38.6 
 
 		 229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1959  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.283843 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  38.79 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2416  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134995  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 216 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 233 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 227 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.05 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  41.89 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4562  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0982939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  39.3 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  41.59 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  40.27 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  40.27 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.27 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0274  DNA-binding response regulator  35.84 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  37.99 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  38.26 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>