More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0772 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  100 
 
 		 200 aa  388  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  38.65 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  35.03 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 249 aa  99  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  33.76 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  35.06 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  36.65 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  35.03 
 
 		 175 aa  86.3  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  35.22 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  33.13 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2044  transcriptional regulator, HxlR family  42.48 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  32.1 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  36.25 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  30.32 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  44.05 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2810  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1472  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  35.62 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  32.12 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1182 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  38.58 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0229  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444604  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  33.33 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 391 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.38 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.81 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  31.15 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0154  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.07 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.443854  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  35.88 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1781  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.01 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1833  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.54 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  30.82 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2510  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.48 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0791346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1990  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.8 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1397  DNA-binding response regulator  27.03 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.22 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0464  DNA-binding response regulator  27.03 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  33.93 
 
 		 803 aa  55.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2389  two component transcriptional regulator  37.32 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1277  DNA-binding response regulator  27.03 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06763  transcriptional regulatory protein CpxR  31.88 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  35.29 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 841 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  34.68 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  35.14 
 
 		 705 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.72 
 
 		 313 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  38.58 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2713  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.65 
 
 		 454 aa  55.1  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0494  two-component response regulator  25.41 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000851  probable transcriptional regulator SyrB  33.61 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00675785  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.64 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  46.58 
 
 		 981 aa  54.7  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  28.95 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  32.95 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1099  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2059  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000985599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  31.55 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  38.71 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  34.39 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1789  alkaline phosphatase synthesis response regulator  36.67 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11323  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  33.59 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  36.13 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  31.55 
 
 		 327 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 523 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  31.13 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  32.95 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  32.95 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0146  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3572  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 457 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  30.77 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1832  DNA-binding response regulator  36.67 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.372268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1150  DNA-binding transcriptional regulator TorR  29.91 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.42 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>