More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2134 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  100 
 
 		 175 aa  351  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  50.65 
 
 		 212 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  51.33 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  45.12 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  45.12 
 
 		 182 aa  140  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  46.2 
 
 		 197 aa  140  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  45.03 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  44.71 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  47.17 
 
 		 249 aa  136  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  45.57 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  46.84 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  45.81 
 
 		 201 aa  130  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  42.94 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 197 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 193 aa  117  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  41.14 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  39.11 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  49.52 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  35.03 
 
 		 200 aa  86.3  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  45.3 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.14 
 
 		 941 aa  75.1  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2044  transcriptional regulator, HxlR family  31.79 
 
 		 357 aa  74.7  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  40.15 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  40.15 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  40.15 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  38.35 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.58 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2806  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 450 aa  67.8  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 226 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  40.31 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0488  DNA-binding response regulator  37.68 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.36 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  38.06 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 462 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 448 aa  65.5  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  32.12 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  42.52 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  42.52 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  42.52 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  42.52 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  42.52 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  42.52 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  42.52 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  42.52 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  41.12 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.17 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  37.29 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  38.66 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  38.66 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  42.52 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.52 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  42.52 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  31.85 
 
 		 237 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  29.28 
 
 		 302 aa  64.3  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 125 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.76 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>