More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1875 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  48.92 
 
 		 190 aa  158  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  49.47 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  50.89 
 
 		 194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  43.68 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  46.86 
 
 		 212 aa  137  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  46.63 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  41.76 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  45.06 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  41.01 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  43.03 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 175 aa  114  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  39.43 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  40.33 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  42.7 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1969  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  41.51 
 
 		 473 aa  71.2  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 		 343 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  44.23 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  44.23 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  43.27 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.81 
 
 		 456 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  42.31 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.75 
 
 		 229 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  47.57 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  36 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  36.84 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.36 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  33.99 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  44.64 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31880  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.51 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.02 
 
 		 463 aa  65.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0548  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  30.37 
 
 		 570 aa  65.1  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.44 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03240  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.64 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  38.61 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1603  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 449 aa  65.1  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  34.86 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  40.54 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.07 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5142  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.555028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0289  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2713  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.17 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 941 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1317  two component transcriptional regulator  41.51 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  39.62 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  41.96 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  40 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  42.86 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2006  response regulator receiver  43.56 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.379718  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.23 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  39.42 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1370  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.204872  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  40.57 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1988  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.8 
 
 		 435 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.77 
 
 		 466 aa  62.4  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  41.07 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  31.21 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>