More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1584 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  100 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  56.38 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 197 aa  177  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 210 aa  177  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  49.47 
 
 		 194 aa  175  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  49.73 
 
 		 193 aa  174  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  48.89 
 
 		 249 aa  174  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  48.45 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  46.24 
 
 		 190 aa  171  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  46.11 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  47.51 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  50.91 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  43.85 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  47.67 
 
 		 183 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  46.91 
 
 		 190 aa  150  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  45.98 
 
 		 186 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  43.89 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  45.51 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  33.76 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  28.65 
 
 		 1374 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.8 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  40 
 
 		 302 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.1 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1287  two component transcriptional regulator  32.86 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0339445  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.63 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4192  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 454 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00227342  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1832  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.92 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  30.82 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3903  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.46 
 
 		 455 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000574971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0372  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3819  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.75 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.785821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2044  transcriptional regulator, HxlR family  33.03 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.81 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0040  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617214  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0022  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  39.81 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0030  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0135  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134918  normal  0.276067 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0049  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.01 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  42.86 
 
 		 516 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  31.07 
 
 		 456 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0365  DNA-binding response regulator SaeR  31.4 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  36.72 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  33.12 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0356  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 456 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  36.28 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0032  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0031  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 677 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0703  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2601  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.5 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  30.89 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4270  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 361 aa  58.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  33.9 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.69 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  38.1 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.51 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  35.29 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0018  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.67 
 
 		 461 aa  58.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  29.01 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 470 aa  58.2  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  29.29 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2239  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.17 
 
 		 457 aa  58.2  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  29.5 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.9 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  37.84 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  31.82 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1090  DNA-binding response regulator  34.86 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00019826  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0862  response regulator receiver protein  40 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.747276  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0168  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.564625  normal  0.730975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0332  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0746  response regulator receiver  31.4 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>