More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1538 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  66.48 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 201 aa  204  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  53.51 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  54.12 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  55.29 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 197 aa  177  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  51.09 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  51.43 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  49.71 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  50 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  47.22 
 
 		 210 aa  166  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  53.59 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  46.71 
 
 		 183 aa  151  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  49.07 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  46.2 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  46.75 
 
 		 183 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  45.65 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  45.1 
 
 		 191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 211 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  46.63 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  41.12 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2044  transcriptional regulator, HxlR family  37.84 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2201  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.59 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.51 
 
 		 391 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  39.2 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.65 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.31 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  36.71 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.71 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2758  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 857 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1490  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.38 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1047  two component transcriptional regulator  35.94 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.13 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2725  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.2 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  33.33 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  41.82 
 
 		 230 aa  62  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  32.81 
 
 		 356 aa  62  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.28 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 342 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 248 aa  62  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.27 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  39.2 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  39.2 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  40.57 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3569  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.28 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  38.68 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2037  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.82 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  31.89 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  33.85 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  39.81 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4110  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704766 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.04 
 
 		 1177 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  32.58 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0608  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4731  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3465  putative PAS/PAC sensor protein  32.33 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  41.88 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  40 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1244  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.683231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1166  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.43 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  40.19 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0507  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  41.12 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  34.68 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.06 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  37.4 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  31.97 
 
 		 472 aa  59.3  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390474  normal  0.0307837 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.2 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>