More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1032 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 218 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  75.58 
 
 		 218 aa  326  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.51 
 
 		 218 aa  305  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.05 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.05 
 
 		 217 aa  293  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  72.3 
 
 		 214 aa  287  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  66.36 
 
 		 219 aa  283  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  66.51 
 
 		 215 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  65.9 
 
 		 217 aa  278  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  64.98 
 
 		 217 aa  274  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  63.38 
 
 		 214 aa  267  8.999999999999999e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.06 
 
 		 217 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.3 
 
 		 218 aa  254  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.09 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  62.67 
 
 		 219 aa  245  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.8 
 
 		 224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.83 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  57.8 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  58.26 
 
 		 222 aa  235  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.53 
 
 		 227 aa  235  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  61.86 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.45 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  58.53 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.06 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  58.06 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 222 aa  227  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.6 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.8 
 
 		 220 aa  226  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  56.68 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.01 
 
 		 228 aa  223  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.21 
 
 		 226 aa  221  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  53 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.92 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.42 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  58.53 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  54.67 
 
 		 222 aa  208  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.34 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 231 aa  171  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  42.47 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.47 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  41.1 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.1 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.1 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.1 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.01 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  41.36 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.2 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.47 
 
 		 225 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  39.91 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  37.84 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2721  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.66 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 283 aa  141  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  37.22 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.64 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  39.73 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>