More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2559 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  100 
 
 		 197 aa  391  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  44.05 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  42.26 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  44.3 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  39.41 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  42.41 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  39.88 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  37.71 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  41.14 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  36.81 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  40.44 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.43 
 
 		 339 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  30.81 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3141  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0831  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 		 480 aa  68.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.39 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0629  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.16 
 
 		 339 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1002 aa  68.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1988  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.69 
 
 		 435 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  35.39 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0703  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 120 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  31.41 
 
 		 1763 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  46.72 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2564  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2951  response regulator receiver protein  36 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  47.12 
 
 		 457 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.52 
 
 		 434 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  43.1 
 
 		 455 aa  64.7  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.52 
 
 		 434 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0018  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.3 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  47.12 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0719  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.8 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0776  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2978  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  46.15 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0836  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.58 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.58 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2150  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0332475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1058  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 462 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0191246 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  37.38 
 
 		 458 aa  62.4  0.000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 384 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 492 aa  62.4  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  45.19 
 
 		 457 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0007  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.829613  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1013 aa  62  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  45.19 
 
 		 457 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.58 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0859  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.58 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  35.88 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  34.81 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  36.21 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.75 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.39 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  37.38 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2864  two-component response regulator  34.56 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384945  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  36.21 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>