More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2371 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  100 
 
 		 182 aa  357  4e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  67.68 
 
 		 183 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  52.15 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  53.59 
 
 		 197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  54.97 
 
 		 193 aa  160  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  52.44 
 
 		 183 aa  160  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  50.29 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  50.65 
 
 		 249 aa  152  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  47.88 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 194 aa  144  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  45.81 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  45.12 
 
 		 175 aa  140  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  45.98 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  43.2 
 
 		 187 aa  138  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  40.59 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 204 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 190 aa  124  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  43.05 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 189 aa  98.6  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  36.65 
 
 		 200 aa  90.1  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.2 
 
 		 237 aa  70.9  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  30.34 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  30.34 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0671  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.54 
 
 		 469 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2044  transcriptional regulator, HxlR family  34.51 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 492 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  31.48 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0791  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC (Ornithine/argininedecarboxylase inhibitor)  33.88 
 
 		 451 aa  64.7  0.0000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.261898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  40.19 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  28.12 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2713  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.44 
 
 		 454 aa  64.7  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 470 aa  64.3  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  40.77 
 
 		 461 aa  64.3  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.79 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  40.19 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  34.11 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0684  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.74 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  39.81 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  24.21 
 
 		 1366 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2574  response regulator  35.4 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  33.06 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 224 aa  62  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3009  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.333093 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 237 aa  62  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  41.12 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2510  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.92 
 
 		 472 aa  61.6  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0791346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.62 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 391 aa  61.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1510  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 448 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  41.12 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.75 
 
 		 391 aa  61.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  39.25 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  41.12 
 
 		 259 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  41.12 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  40.19 
 
 		 256 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.3 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  39.81 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.94 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  32.23 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.28 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1287  two component transcriptional regulator  40.2 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0339445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  37.29 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  37.29 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  33.87 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3717  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 977 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3732  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.8 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.655402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  24.74 
 
 		 1374 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.59 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.8 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.45 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0799  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.01 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4907  putative response regulator in two-component reguatory system, sigma54 dependent transcriptional regulator  37.84 
 
 		 452 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2487  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.17 
 
 		 735 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  36.22 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  37.69 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 470 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.12 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1657  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 459 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000574549  normal  0.302016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>