More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3741 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  63.64 
 
 
190 aa  240  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  53.44 
 
 
201 aa  194  6e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  48.4 
 
 
194 aa  178  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  48.39 
 
 
197 aa  177  9e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  49.73 
 
 
193 aa  171  9e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  54.9 
 
 
249 aa  167  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  47.22 
 
 
197 aa  166  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  43.68 
 
 
194 aa  161  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  47.22 
 
 
187 aa  160  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  45.95 
 
 
212 aa  157  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  46.37 
 
 
193 aa  156  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  45.7 
 
 
186 aa  153  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  48.17 
 
 
183 aa  148  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  47.88 
 
 
182 aa  145  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  45.12 
 
 
175 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  46.75 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  43.53 
 
 
183 aa  131  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  39.41 
 
 
197 aa  122  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  46.54 
 
 
204 aa  119  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  42.21 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
189 aa  106  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  37.08 
 
 
211 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  41.74 
 
 
259 aa  82  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.53 
 
 
941 aa  80.5  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  44.92 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  37.06 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 
232 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  32.1 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  32.1 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2672  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  36.8 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.83 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.83 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
492 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  38.35 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  34.07 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  34.07 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  39.52 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  37.69 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  36.22 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  36.03 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  36.64 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  34.35 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  35.88 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  34.35 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  34.35 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  34.44 
 
 
1130 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0620  response regulator receiver protein  36.51 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  36.92 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  30 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0254  DNA-binding response regulator  36.92 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000466037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  40.32 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  30 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  32.79 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  36.81 
 
 
1133 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  34.4 
 
 
225 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 
230 aa  72  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1483  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 
225 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0288957  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  38.41 
 
 
242 aa  72  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 
230 aa  72  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.92 
 
 
233 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 
262 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0365  DNA-binding response regulator SaeR  32.5 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.46 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  39.34 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  39.52 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0730  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  36.97 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0746  response regulator receiver  32.48 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  44.44 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  36.13 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  38.14 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>