More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2553 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  100 
 
 		 187 aa  367  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  51.09 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  48.92 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  50 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  50.52 
 
 		 249 aa  167  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  48.91 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  47.22 
 
 		 210 aa  160  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  47.51 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  50.89 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  44.51 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  45.7 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  43.2 
 
 		 182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  43.79 
 
 		 183 aa  134  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  45.4 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  45.96 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  42.94 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  38.95 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  43.62 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  36.81 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  43.03 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  33.13 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.17 
 
 		 941 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0286  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  39.84 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  40.68 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  40.68 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  37.3 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  39.68 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5993  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.8 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 513 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  37.9 
 
 		 231 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5762  two component transcriptional regulator  39.2 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120401  normal  0.403713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4117  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.167574 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  36.13 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  35.29 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3049  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  32.23 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2725  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.13 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0720  DNA-binding response regulator  35.25 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2201  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 227 aa  62  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2390  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.23 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2339  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.29 
 
 		 459 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701331 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  33.33 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 226 aa  62  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25 
 
 		 448 aa  62  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  35.54 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2672  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  32.61 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  36.3 
 
 		 244 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5596  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1166  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3345  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5047  response regulator receiver protein  25.79 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.98 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  34.9 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.97 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  35.2 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2350  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.6 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275786  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2234  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.97 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1173  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.29 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.68 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2505  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791438  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  32.05 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08151  response regulator  27.61 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.59 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0308  putative response regulator  28.69 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3216  type IV pilus expression regulatory protein  35.2 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>