More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1820 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  100 
 
 		 211 aa  413  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  45.81 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  47.65 
 
 		 183 aa  146  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  43.35 
 
 		 183 aa  131  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  44.89 
 
 		 201 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  41.81 
 
 		 193 aa  125  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  41.52 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  38.69 
 
 		 194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  37.99 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  38.92 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 190 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 175 aa  98.2  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  40.44 
 
 		 186 aa  88.2  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 191 aa  86.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  38.95 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  30.81 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.51 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02228  hypothetical protein  32.48 
 
 		 513 aa  58.2  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2124  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.09 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0345179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0176  two-component response regulator AlgB  35.83 
 
 		 450 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003533  putative LuxO repressor protein  30.53 
 
 		 503 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0730  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0746  response regulator receiver  30.43 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0334  alginate biosynthesis transcriptional regulatory protein AlgB  35.59 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0263  helix-turn-helix, Fis-type  35.59 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0148  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 448 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0133  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.75 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0150  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  39.17 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5095  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 448 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0046  two-component response regulator AlgB  36.67 
 
 		 448 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0485  two component transcriptional regulator  33.08 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1737  two component transcriptional regulator  28.72 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151372  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 394 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.99 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0634  DNA-binding response regulator  33.09 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.99 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.11 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0484  response regulator  31.16 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2487  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.06 
 
 		 735 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  36.27 
 
 		 349 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0356  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.06 
 
 		 360 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1086  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.08 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0540  DNA-binding response regulator  33.08 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0312  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.56 
 
 		 463 aa  52.8  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.902205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0571  DNA-binding response regulator  33.08 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0627  DNA-binding response regulator  33.08 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0365  DNA-binding response regulator SaeR  29.57 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0482  response regulator  32.33 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0702  DNA-binding response regulator  32.33 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0306  two-component response regulator,transcriptional regulatory protein LuxO  27.94 
 
 		 501 aa  52.4  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72380  two-component response regulator AlgB  33.85 
 
 		 449 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.415261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1287  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0339445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4731  DNA-binding response regulator  33.08 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0925  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 500 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6282  two-component response regulator AlgB  35.78 
 
 		 449 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1542  response regulator receiver domain-containing protein  31.06 
 
 		 309 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150385  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0608  DNA-binding response regulator  32.33 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  32.2 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3201  response regulator receiver domain-containing protein  30.56 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 758 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1969  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  30.33 
 
 		 473 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2020  response regulator receiver and unknown domain protein  24.06 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  30.72 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5047  response regulator receiver protein  25.44 
 
 		 521 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1269  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.71 
 
 		 509 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3764  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 121 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.105051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1275  DNA-binding response regulator  27.98 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  31.09 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  34.23 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0671  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.63 
 
 		 469 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4054  two component transcriptional regulator  32.82 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0155  response regulator receiver domain protein  31.62 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.37446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2672  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2133  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.3 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.809783 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 498 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0791  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC (Ornithine/argininedecarboxylase inhibitor)  31.45 
 
 		 451 aa  49.3  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.261898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  27.98 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>