More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2545 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  100 
 
 		 194 aa  380  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  75.13 
 
 		 194 aa  288  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  58.1 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  48.97 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  53.29 
 
 		 249 aa  177  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 190 aa  175  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  49.47 
 
 		 197 aa  175  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  48.88 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  43.68 
 
 		 210 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  50.89 
 
 		 187 aa  159  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  51.85 
 
 		 183 aa  150  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  45.56 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  46.71 
 
 		 186 aa  148  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 182 aa  144  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  43.98 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  42.26 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  42.35 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  50.89 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  45.95 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  37.99 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02660  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.46 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.646611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  34.93 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  30.95 
 
 		 1374 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.71 
 
 		 277 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  37.78 
 
 		 302 aa  72  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.19 
 
 		 491 aa  71.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0018  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.19 
 
 		 461 aa  71.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.66 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  36.29 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1988  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.71 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  35.82 
 
 		 961 aa  68.9  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1370  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0289  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  33.71 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0644  hypothetical protein  28.5 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0608  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0484  response regulator  36.29 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1490  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.45 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.25 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0702  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  38.46 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.59 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.21 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  37.5 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.52 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2464  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  32.61 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0482  response regulator  37.07 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  38.28 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  35.66 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  30.4 
 
 		 1335 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  38.46 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  38.79 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.84 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  39.62 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  41.32 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 391 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  36.64 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  28.19 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  35.2 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  31.58 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  41.32 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  37.88 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>