More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2885 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  75.13 
 
 		 194 aa  288  4e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  54.69 
 
 		 193 aa  204  9e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  55.85 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  59.12 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  54.12 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  50.55 
 
 		 190 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  48.4 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  46.11 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  48.92 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  50.29 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  44.32 
 
 		 193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  45.98 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  45.03 
 
 		 175 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  41.97 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  49.71 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  42.51 
 
 		 183 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  44.3 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  38.65 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  44.37 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  38.69 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  36.91 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 941 aa  78.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  42.5 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.97 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1342  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0144629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  41.32 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0896  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232326  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  38.28 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  41.03 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  30.39 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  30.39 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0732  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 471 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.24 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 242 aa  71.2  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.38 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.19 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  30.39 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  36.02 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.88 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  34.07 
 
 		 705 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1988  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.88 
 
 		 435 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.88 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  34.38 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  37.04 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  41.88 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  29.74 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  40 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  39.17 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  32.04 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  28.89 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 492 aa  68.2  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 383 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2044  transcriptional regulator, HxlR family  37.27 
 
 		 357 aa  68.2  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0007  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 		 379 aa  68.2  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.829613  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0644  hypothetical protein  28.34 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1192  DNA-binding response regulator  37.29 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00982401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 383 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>