More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1740 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  100 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  47.67 
 
 		 190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  45.51 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  45.1 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  46.36 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  46.63 
 
 		 212 aa  124  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  42.77 
 
 		 190 aa  121  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  42.21 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 201 aa  111  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  39.88 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  42.01 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  43.62 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  42.47 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  40 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  36.99 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  38.22 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  49.52 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 204 aa  88.2  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  40.44 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  44.44 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  47 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  44.05 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0684  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.81 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0671  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.81 
 
 		 469 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2644  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.05 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.1 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  31.98 
 
 		 577 aa  62.4  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.43 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4351  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.997672  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  38.26 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.82 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  34 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  33.09 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1622  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0372  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.21 
 
 		 461 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  43.43 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  32.09 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2371  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.38 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0039  DNA-binding response regulator  30.99 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  35.78 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.12 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  38.26 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 382 aa  58.2  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  41.12 
 
 		 351 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1745  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  31.3 
 
 		 468 aa  58.2  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.69 
 
 		 391 aa  57.8  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1361  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  41.84 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2676  DNA-binding response regulator  30.99 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0255  DNA-binding response regulator  30.99 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2713  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.19 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2737  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00154696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0753  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 241 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 236 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1895  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.818173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3276  DNA-binding response regulator  30.99 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1851  DNA-binding response regulator  30.99 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0042  DNA-binding response regulator  30.99 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0042  DNA-binding response regulator  30.99 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2701  DNA-binding response regulator  30.99 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  35.92 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.76 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 		 343 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.9 
 
 		 458 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.59 
 
 		 1177 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>