More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1627 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 218 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  73.73 
 
 		 217 aa  323  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.58 
 
 		 217 aa  323  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.58 
 
 		 217 aa  322  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  71.89 
 
 		 217 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  71.63 
 
 		 215 aa  312  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  73.39 
 
 		 218 aa  311  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  71.36 
 
 		 214 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.89 
 
 		 218 aa  298  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.05 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  68.2 
 
 		 219 aa  295  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  71.83 
 
 		 214 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  68.81 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  64.98 
 
 		 222 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  68.37 
 
 		 217 aa  266  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  64.98 
 
 		 222 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.84 
 
 		 218 aa  265  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.21 
 
 		 218 aa  265  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.75 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.52 
 
 		 218 aa  262  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  65.6 
 
 		 219 aa  261  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.06 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 217 aa  251  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.14 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 235 aa  241  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.76 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 227 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.34 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  59.15 
 
 		 222 aa  236  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.45 
 
 		 224 aa  234  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.83 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  57.6 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 227 aa  229  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.48 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.83 
 
 		 234 aa  224  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.76 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  60.37 
 
 		 221 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.29 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  45.91 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  43.84 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.84 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 235 aa  167  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.38 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  42.01 
 
 		 224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.01 
 
 		 224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.01 
 
 		 224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.01 
 
 		 224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.37 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.27 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.99 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  42.86 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  44.55 
 
 		 253 aa  158  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  42.27 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 283 aa  157  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.29 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  42.4 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.1 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  41.55 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  39.45 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.66 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  39.45 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 231 aa  154  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 248 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>