More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4521 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  70.59 
 
 		 222 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  70.14 
 
 		 222 aa  311  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.21 
 
 		 220 aa  275  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  67.28 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  59.45 
 
 		 217 aa  261  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.83 
 
 		 218 aa  261  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.75 
 
 		 217 aa  261  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.61 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.37 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  58.99 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 218 aa  252  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  58.26 
 
 		 219 aa  251  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  58.14 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 218 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 217 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.34 
 
 		 214 aa  244  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  56.34 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.92 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.96 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.02 
 
 		 218 aa  228  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  54.67 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  53 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.5 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  53 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 221 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  53.49 
 
 		 217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.81 
 
 		 234 aa  211  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  52.07 
 
 		 219 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 243 aa  188  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.7 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  48.62 
 
 		 231 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.17 
 
 		 227 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.62 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  45 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.61 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  45.66 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.66 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.66 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.66 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.2 
 
 		 228 aa  174  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.29 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  44.75 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.75 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.29 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.64 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  45.95 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.84 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.75 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  43.84 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  41.63 
 
 		 253 aa  164  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  43.84 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00315  probable two component response regulator transcription regulator protein  39.64 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1713  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.26 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  43.63 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 223 aa  161  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.66 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  37.55 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.19 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  40.36 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  41.55 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 227 aa  157  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  44.34 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.78 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.91 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>