More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7133 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  90.91 
 
 		 231 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  91.44 
 
 		 235 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  86.78 
 
 		 227 aa  364  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  89.91 
 
 		 224 aa  358  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  90.19 
 
 		 228 aa  356  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  89.04 
 
 		 227 aa  355  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  84.68 
 
 		 222 aa  346  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  75 
 
 		 227 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.11 
 
 		 224 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.83 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 218 aa  245  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  58.99 
 
 		 217 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  58.06 
 
 		 217 aa  241  9e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.22 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  55.76 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.68 
 
 		 218 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.46 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  58.14 
 
 		 215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  55.3 
 
 		 218 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.22 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  54.46 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  54.82 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.07 
 
 		 218 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  52.07 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  52.07 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.15 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.61 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.91 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  52.53 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  49.3 
 
 		 222 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.53 
 
 		 220 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.71 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.3 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.54 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  49.77 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  41.67 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  45.25 
 
 		 224 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.62 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  41.82 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.01 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.58 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  39.8 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.62 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  39.45 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.27 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  39.27 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.27 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.27 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.27 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  36.87 
 
 		 225 aa  148  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 227 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  36.7 
 
 		 223 aa  148  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 224 aa  148  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 225 aa  148  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  38.36 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.36 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  38.36 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.36 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 283 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.36 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.36 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.77 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  45 
 
 		 219 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  38.53 
 
 		 253 aa  144  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.04 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  36.82 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  38.63 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  36.99 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>