More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5651 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  100 
 
 		 222 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  72.3 
 
 		 221 aa  292  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.2 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.15 
 
 		 218 aa  236  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  57.75 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.01 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  57.28 
 
 		 218 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.28 
 
 		 217 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  54.93 
 
 		 217 aa  228  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.67 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.69 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  53.52 
 
 		 215 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.05 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.58 
 
 		 214 aa  218  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.81 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  56.81 
 
 		 231 aa  214  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  55.4 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.11 
 
 		 217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.87 
 
 		 217 aa  211  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  51.64 
 
 		 219 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  52.31 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.67 
 
 		 218 aa  208  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 		 222 aa  208  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.14 
 
 		 218 aa  207  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  53.55 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.93 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.77 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  53.05 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.42 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.87 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.93 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  49.3 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  49.3 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.48 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.83 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.83 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.95 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.69 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.15 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.58 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 231 aa  171  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  46.98 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.98 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.09 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  42.79 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  41.01 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.79 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.79 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.79 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.49 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.52 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  40.47 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.47 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.47 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.47 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.33 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  42.22 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.12 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  46.33 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.12 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.33 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.93 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  42.59 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  41.86 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.86 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 283 aa  151  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.86 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.86 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.86 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.78 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  41.01 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.78 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.78 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  38.12 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  40.74 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.93 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.84 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  44.14 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.25 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  41.67 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  40.74 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1713  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.01 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>