More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8629 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 218 aa  420  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.36 
 
 		 217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.52 
 
 		 218 aa  268  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  67.91 
 
 		 217 aa  267  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.21 
 
 		 218 aa  266  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  64.52 
 
 		 217 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.3 
 
 		 218 aa  258  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  63.13 
 
 		 218 aa  258  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  61.75 
 
 		 217 aa  256  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  62.79 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  58.72 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.15 
 
 		 214 aa  252  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 217 aa  246  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  58.72 
 
 		 222 aa  238  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  58.72 
 
 		 222 aa  238  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.37 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  61.97 
 
 		 214 aa  235  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.34 
 
 		 224 aa  234  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.88 
 
 		 218 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  57.6 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.3 
 
 		 218 aa  225  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.3 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.5 
 
 		 223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  56.68 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.42 
 
 		 220 aa  221  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  55.14 
 
 		 222 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  53 
 
 		 218 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.76 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.38 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.21 
 
 		 228 aa  208  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  54.84 
 
 		 231 aa  207  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.3 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.38 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.26 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  52.07 
 
 		 243 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  55.3 
 
 		 221 aa  198  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  45.45 
 
 		 253 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 224 aa  160  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  41.1 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  42.92 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.92 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  41.1 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  42.27 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.47 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.73 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  43.18 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  39.27 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.27 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.27 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.27 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  41.82 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.13 
 
 		 221 aa  147  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  46.08 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2714  putative two-component response regulator  38.81 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31960  putative two-component response regulator  38.81 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.029957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 226 aa  145  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.82 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.91 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.16 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 222 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.82 
 
 		 684 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.2 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>