More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0520 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  91.4 
 
 		 235 aa  370  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  90.83 
 
 		 231 aa  364  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  89.91 
 
 		 243 aa  359  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  87.95 
 
 		 227 aa  356  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  87.27 
 
 		 227 aa  353  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  86.92 
 
 		 228 aa  346  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.71 
 
 		 222 aa  340  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  76.44 
 
 		 227 aa  309  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.84 
 
 		 224 aa  269  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.61 
 
 		 226 aa  263  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.45 
 
 		 218 aa  251  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.45 
 
 		 217 aa  244  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  58.53 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.28 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.06 
 
 		 217 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  58.53 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.6 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  55.76 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  58.6 
 
 		 215 aa  235  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 218 aa  234  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  56.68 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  55.87 
 
 		 214 aa  227  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  54.84 
 
 		 222 aa  221  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  57.6 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  54.38 
 
 		 222 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.53 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.38 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.6 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.46 
 
 		 220 aa  207  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.07 
 
 		 217 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  51.15 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  51.16 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.47 
 
 		 218 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 221 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 234 aa  175  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  42.73 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.26 
 
 		 224 aa  158  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  45.25 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.38 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  38.07 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.64 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  38.57 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.77 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  39.73 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.64 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  38.93 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.81 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 255 aa  148  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  37.67 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.67 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  46.08 
 
 		 219 aa  147  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.81 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  40.27 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.5 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>