More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0861 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  425  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.51 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  48.62 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.08 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.17 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  50.46 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.17 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.14 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  49.08 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.05 
 
 		 214 aa  168  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  47.25 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.71 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.39 
 
 		 218 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  46.54 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.79 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 218 aa  161  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  48.61 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  43.72 
 
 		 222 aa  157  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  43.44 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  43.89 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1713  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.97 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  43.07 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9846  two component response regulator  36 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  42.6 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.99 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  45.89 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  41.15 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 223 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  39.11 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3156  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3511  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3971  hypothetical protein  43.41 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3412  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  39.55 
 
 		 247 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1614  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  39.55 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  33.78 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.95 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  34.82 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.15 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  39.55 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2714  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>