More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3971 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3971  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3241  two-component transcriptional regulator  93.3 
 
 		 224 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.582303  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3977  two component transcriptional regulator  93.3 
 
 		 224 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.84 
 
 		 229 aa  284  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.95 
 
 		 227 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9846  two component response regulator  61.61 
 
 		 225 aa  280  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 		 226 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  59.82 
 
 		 223 aa  267  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  57.96 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  57.85 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.78 
 
 		 232 aa  261  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 		 231 aa  261  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  56.7 
 
 		 225 aa  261  8.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.52 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  56.25 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  55.8 
 
 		 227 aa  255  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  57.59 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.19 
 
 		 226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  57.59 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  57.59 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  57.52 
 
 		 228 aa  251  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  56.64 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  56.39 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  54.71 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.71 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  55.8 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.89 
 
 		 226 aa  248  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 228 aa  248  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  55.75 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.26 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  53.57 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  55.31 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.87 
 
 		 241 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  55.31 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  54.22 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 230 aa  241  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 		 234 aa  241  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 		 226 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  52.44 
 
 		 226 aa  238  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 223 aa  238  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  53.57 
 
 		 228 aa  234  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 		 228 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  53.91 
 
 		 232 aa  228  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 229 aa  225  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  49.09 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6011  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2085  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2066  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.35 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0016  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.02 
 
 		 225 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0311  two component transcriptional regulator  60.27 
 
 		 244 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.019711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 225 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0274  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 272 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  52.47 
 
 		 225 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2102  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1972  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 258 aa  220  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  47.56 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  52.44 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 223 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5688  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0612982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3752  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4616  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.055256 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.54 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.22 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3297  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  47.51 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.441835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3127  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.51 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.674952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.02 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.47 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0850  two component response regulator  48.43 
 
 		 225 aa  215  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.57 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 225 aa  214  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.09 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  47.3 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0282  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.919503  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0281  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000001543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3740  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  49.12 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4428  DNA-binding response regulator  47.53 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.12 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.12 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4783  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000784885  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.12 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.02 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.02 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.02 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2234  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4110  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.36 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>