More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0767 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 229 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  96 
 
 		 227 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9846  two component response regulator  67.71 
 
 		 225 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  60.09 
 
 		 223 aa  271  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  57.21 
 
 		 226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  59.01 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3971  hypothetical protein  63.84 
 
 		 224 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.33 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3241  two-component transcriptional regulator  62.95 
 
 		 224 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.582303  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3977  two component transcriptional regulator  62.95 
 
 		 224 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  57.78 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  57.78 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  57.59 
 
 		 228 aa  261  6e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  57.78 
 
 		 255 aa  261  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  58.11 
 
 		 227 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.64 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  57.4 
 
 		 238 aa  258  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  58.04 
 
 		 228 aa  258  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.59 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.31 
 
 		 232 aa  256  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  56.19 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.41 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.75 
 
 		 232 aa  255  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  55.86 
 
 		 227 aa  254  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  55.16 
 
 		 224 aa  254  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  56 
 
 		 249 aa  254  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.25 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  55.71 
 
 		 241 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  55.25 
 
 		 252 aa  251  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.2 
 
 		 226 aa  249  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  53.42 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  54.79 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  54.34 
 
 		 241 aa  247  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  53.42 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  54.34 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 226 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 		 223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  54.05 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  53.6 
 
 		 225 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.23 
 
 		 227 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  49.77 
 
 		 226 aa  229  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.68 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  53.51 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.58 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0311  two component transcriptional regulator  56.58 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.019711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0016  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.8 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3127  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.33 
 
 		 227 aa  224  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.674952  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3297  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  51.33 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.441835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.51 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  51.79 
 
 		 228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.67 
 
 		 225 aa  221  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  50.66 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  47.32 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.2 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  49.77 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.02 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.57 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.25 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.25 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.25 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3519  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683413  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.2 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.2 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.2 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.2 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 226 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2409  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 226 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.615174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 226 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2907  winged helix family two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00514074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1103  DNA-binding response regulator IrlR  50 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0630149  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2716  DNA-binding heavy metal response regulator  50 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2876  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.5251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2869  transcriptional activator protein IrlR  50 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.354021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2784  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0376  DNA-binding response regulator IrlR  49.55 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.083776  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  49.55 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 		 226 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  48.88 
 
 		 224 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.88 
 
 		 224 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>