More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1264 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1264  response regulator receiver protein  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1664  response regulator receiver protein  53.19 
 
 		 193 aa  191  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1858  response regulator receiver protein  48.24 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1208  response regulator receiver protein  47.12 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000244573  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1584  response regulator receiver protein  46.91 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.449459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3536  response regulator receiver protein  49.69 
 
 		 249 aa  149  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1538  response regulator receiver protein  49.07 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1750  response regulator receiver protein  47.2 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425063  normal  0.505119 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1740  response regulator receiver protein  47.67 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2545  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0974258  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  47.13 
 
 		 190 aa  140  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  46.75 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1875  response regulator receiver protein  48.92 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2134  response regulator receiver protein  44.71 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2885  response regulator receiver protein  41.97 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2012  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2553  response regulator receiver protein  45.96 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.165021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  41.61 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2371  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 182 aa  124  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1770  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1773  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1820  response regulator receiver protein  39.18 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2559  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.213009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0772  response regulator receiver protein  30.32 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.83 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.09 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.19 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  40.18 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0816  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  35.88 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0314  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0234873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000482292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  35.09 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2255  two component transcriptional regulator, Fis family  33.05 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4117  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.167574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2343  two component transcriptional regulator, Fis family  33.05 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.12 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1607  two component Fis family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.016434  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.45 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0620  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.51 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  34.82 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  27.34 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  31.43 
 
 		 1127 aa  55.1  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1397  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.0186572 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2205  two component Fis family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.57 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2171  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 480 aa  54.7  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0965  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 411 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.656429  normal  0.215977 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0154  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.443854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.71 
 
 		 709 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  32.06 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 941 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0308  putative response regulator  30.58 
 
 		 506 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  30 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.82 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.17 
 
 		 446 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  32.06 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  31.54 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  32.18 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 639 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 239 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  31.54 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  37.27 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4153  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.61 
 
 		 466 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  31.54 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>