More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3049 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3049  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4882  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 224 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2540  response regulator receiver  51.97 
 
 		 231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0465  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2732  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6964  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 226 aa  224  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.043471  normal  0.107802 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6736  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.523736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3158  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2586  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1332  response regulator receiver  43.24 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3534  two-component system response regulator  43.89 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4553  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.130056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0720  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5580  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4933  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.742602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1449  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  38.84 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1185  response regulator receiver  36.49 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  35.29 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 265 aa  142  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  37.22 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  37.22 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  37.22 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  37.1 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2714  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3527  two component response regulator  39.19 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1026  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.602411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2701  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3079  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3336  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.523001 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  33.33 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0525  transcriptional regulatory protein  37.1 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369528  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1569  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  33.94 
 
 		 219 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6533  cell cycle transcriptional regulator CtrA  37.1 
 
 		 233 aa  137  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2805  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3371  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.442318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.81 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2605  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1861  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  34.09 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4233  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0736222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1139  DNA-binding response regulator  36.65 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.034136  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1019  cell cycle transcriptional regulator CtrA  38.01 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.736916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3912  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1822  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.077619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3672  winged helix family two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0563  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.621979  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0985  DNA-binding response regulator CiaR  35 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.447626  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1599  cell cycle transcriptional regulator CtrA  39.19 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1542  cell cycle transcriptional regulator CtrA  39.19 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6127  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2174  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0824  response regulator receiver  37.1 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  35.91 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0784  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.182528 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.91 
 
 		 219 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2135  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  33.63 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1348  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  33.63 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1508  cell cycle transcriptional regulator ctrA  37.1 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1332  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  33.63 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1953  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  33.63 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1310  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  33.63 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.237463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0747  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  0.934966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  35.91 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3946  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 233 aa  134  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26309  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  33.03 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5573  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0303  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1433  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3016  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1399  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3622  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0114155  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  35.45 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1250  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  32.29 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  34.38 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2473  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  32.29 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.751348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1293  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  32.29 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  35.45 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  35.91 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1995  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  32.29 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.89 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>