More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6964 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6964  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.043471  normal  0.107802 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6736  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.27 
 
 		 226 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.523736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4553  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.57 
 
 		 227 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.130056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2732  two component transcriptional regulator  56.76 
 
 		 225 aa  263  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0465  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 225 aa  248  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2540  response regulator receiver  49.12 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4882  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.82 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4933  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.742602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3158  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0720  DNA-binding response regulator  48.64 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2586  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 227 aa  221  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3049  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1332  response regulator receiver  45.74 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3534  two-component system response regulator  43.64 
 
 		 225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1449  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5580  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1185  response regulator receiver  36.2 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  36.36 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 652 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0242  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  37.73 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 265 aa  151  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0142  DNA-binding response regulator  38.5 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1810  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0562957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.75 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 406 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1512  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1561  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 227 aa  147  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 799 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  37.39 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1956  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000121146  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  33.78 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 229 aa  145  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  36.44 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.44 
 
 		 231 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5423  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 239 aa  144  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  35.75 
 
 		 219 aa  144  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1192  DNA-binding response regulator  33.18 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00982401  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  32.74 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  34.09 
 
 		 228 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2605  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3527  two component response regulator  36.89 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  35.06 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  35.06 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1569  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  35.06 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2213  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  36.44 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  35.19 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3336  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.523001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3079  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.91 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1599  cell cycle transcriptional regulator CtrA  36.44 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1542  cell cycle transcriptional regulator CtrA  36.44 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  35.06 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  34.63 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0563  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 235 aa  141  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.621979  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.74 
 
 		 238 aa  141  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  34.63 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 224 aa  141  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>