More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0525 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3336  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.56 
 
 		 233 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.523001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3079  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.56 
 
 		 233 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2605  two component transcriptional regulator  71.11 
 
 		 233 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3527  two component response regulator  71.11 
 
 		 233 aa  336  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0303  two component transcriptional regulator  69.91 
 
 		 233 aa  334  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2505  two component transcriptional regulator  69.2 
 
 		 238 aa  333  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791438  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3622  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.8 
 
 		 233 aa  332  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0114155  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2213  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  71.24 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3946  two component transcriptional regulator  70.8 
 
 		 233 aa  332  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26309  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0784  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.98 
 
 		 233 aa  332  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0824  response regulator receiver  70.98 
 
 		 233 aa  332  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0344  two component transcriptional regulator  70.35 
 
 		 233 aa  332  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2174  two component transcriptional regulator  70.54 
 
 		 235 aa  332  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0747  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.98 
 
 		 233 aa  331  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  0.934966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5573  two component transcriptional regulator  70.8 
 
 		 233 aa  331  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1599  cell cycle transcriptional regulator CtrA  70.67 
 
 		 232 aa  329  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4233  two component transcriptional regulator  70.35 
 
 		 233 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0736222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1822  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.35 
 
 		 233 aa  329  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.077619  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1542  cell cycle transcriptional regulator CtrA  70.67 
 
 		 232 aa  329  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3912  two component transcriptional regulator  70.98 
 
 		 233 aa  328  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3672  winged helix family two component transcriptional regulator  70.98 
 
 		 233 aa  328  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4854  two component transcriptional regulator  69.47 
 
 		 231 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6533  cell cycle transcriptional regulator CtrA  70.35 
 
 		 233 aa  328  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1569  two component transcriptional regulator  70.22 
 
 		 232 aa  328  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3488  two component transcriptional regulator  68.75 
 
 		 233 aa  328  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.487721  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1279  two component transcriptional regulator  67.86 
 
 		 237 aa  328  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461363  normal  0.257738 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2621  two component transcriptional regulator  67.86 
 
 		 237 aa  328  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75303  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1399  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 239 aa  327  8e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0525  transcriptional regulatory protein  69.91 
 
 		 233 aa  327  9e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369528  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1903  two component transcriptional regulator  67.41 
 
 		 237 aa  327  9e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3371  two component transcriptional regulator  69.91 
 
 		 233 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.442318  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  68.75 
 
 		 231 aa  325  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1508  cell cycle transcriptional regulator ctrA  65.69 
 
 		 237 aa  325  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6127  two component transcriptional regulator  69.96 
 
 		 233 aa  323  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2529  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.91 
 
 		 233 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1026  two component transcriptional regulator  67.26 
 
 		 231 aa  323  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0563  two component transcriptional regulator  68.58 
 
 		 235 aa  322  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.621979  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1019  cell cycle transcriptional regulator CtrA  67.86 
 
 		 233 aa  316  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5319  cell cycle transcriptional regulator CtrA  63.84 
 
 		 233 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983847 
 
 
-
 
NC_002978  WD0732  cell cycle transcriptional regulator  53.07 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1202  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.99 
 
 		 244 aa  244  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  54.78 
 
 		 266 aa  242  3e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  54.78 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4096  two component transcriptional regulator  61.45 
 
 		 184 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0234  DNA-binding response regulator  37.96 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  40.36 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3297  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  40.89 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.441835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3127  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.89 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.674952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  40.64 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  42.92 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  41.55 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 		 799 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 229 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0723  transcriptional regulator, response regulator  38.39 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000482292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1830  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  39.82 
 
 		 219 aa  162  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 219 aa  162  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 221 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 221 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02836  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R2 (raxR2)  41.36 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 		 635 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>