More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1026 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1026  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  84.42 
 
 		 231 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3622  two component transcriptional regulator, winged helix family  84.51 
 
 		 233 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0114155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3946  two component transcriptional regulator  84.51 
 
 		 233 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26309  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0747  two component transcriptional regulator, winged helix family  84.51 
 
 		 233 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  0.934966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0344  two component transcriptional regulator  83.7 
 
 		 233 aa  398  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0824  response regulator receiver  84.51 
 
 		 233 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3336  two component transcriptional regulator, winged helix family  84.44 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.523001 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0525  transcriptional regulatory protein  83.19 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369528  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2605  two component transcriptional regulator  84.82 
 
 		 233 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0784  two component transcriptional regulator, winged helix family  84.51 
 
 		 233 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3912  two component transcriptional regulator  83.63 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1822  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.63 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.077619  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5573  two component transcriptional regulator  85.27 
 
 		 233 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4233  two component transcriptional regulator  82.97 
 
 		 233 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0736222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3079  two component transcriptional regulator, winged helix family  84.44 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3672  winged helix family two component transcriptional regulator  83.63 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3527  two component response regulator  84 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2213  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  83.12 
 
 		 249 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2174  two component transcriptional regulator  84.07 
 
 		 235 aa  394  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6533  cell cycle transcriptional regulator CtrA  83.19 
 
 		 233 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3371  two component transcriptional regulator  82.53 
 
 		 233 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.442318  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3488  two component transcriptional regulator  83.48 
 
 		 233 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.487721  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1569  two component transcriptional regulator  82.02 
 
 		 232 aa  390  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1599  cell cycle transcriptional regulator CtrA  82.02 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6127  two component transcriptional regulator  81.9 
 
 		 233 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1542  cell cycle transcriptional regulator CtrA  82.02 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2529  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.04 
 
 		 233 aa  387  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0303  two component transcriptional regulator  78.6 
 
 		 233 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1019  cell cycle transcriptional regulator CtrA  82.14 
 
 		 233 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4854  two component transcriptional regulator  78.35 
 
 		 231 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0563  two component transcriptional regulator  77.53 
 
 		 235 aa  370  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.621979  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1279  two component transcriptional regulator  76.34 
 
 		 237 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461363  normal  0.257738 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2621  two component transcriptional regulator  76.34 
 
 		 237 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75303  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1903  two component transcriptional regulator  75.89 
 
 		 237 aa  363  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1399  two component transcriptional regulator  72.73 
 
 		 239 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1508  cell cycle transcriptional regulator ctrA  72.29 
 
 		 237 aa  360  9e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5319  cell cycle transcriptional regulator CtrA  71.81 
 
 		 233 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2505  two component transcriptional regulator  74.03 
 
 		 238 aa  352  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791438  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  67.26 
 
 		 239 aa  323  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0732  cell cycle transcriptional regulator  56.77 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  53.74 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  53.74 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1202  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4096  two component transcriptional regulator  67.04 
 
 		 184 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0234  DNA-binding response regulator  40.6 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  42.47 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1830  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 250 aa  165  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02836  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R2 (raxR2)  37.22 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  39.01 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  37.44 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0042  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2676  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0255  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2701  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3276  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1851  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0042  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  38.1 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0039  DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4040  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  39.37 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 229 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5125  two component response regulator  38.84 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1264  response regulator receiver  36.36 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  37.95 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0574  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.821306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>