More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1202 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1202  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 244 aa  490  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  52.99 
 
 		 239 aa  254  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3488  two component transcriptional regulator  54.95 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.487721  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0824  response regulator receiver  55.41 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0784  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.41 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2505  two component transcriptional regulator  52.1 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791438  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2605  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0747  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 233 aa  248  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  0.934966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3527  two component response regulator  55.41 
 
 		 233 aa  248  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2174  two component transcriptional regulator  54.95 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3946  two component transcriptional regulator  54.95 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26309  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3336  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.523001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3079  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1822  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.05 
 
 		 233 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.077619  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3622  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 233 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0114155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5573  two component transcriptional regulator  54.95 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3912  two component transcriptional regulator  54.05 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4233  two component transcriptional regulator  54.05 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0736222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3672  winged helix family two component transcriptional regulator  54.05 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0344  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1019  cell cycle transcriptional regulator CtrA  54.5 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.736916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2213  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  54.95 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0525  transcriptional regulatory protein  53.6 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369528  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1569  two component transcriptional regulator  54.05 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1026  two component transcriptional regulator  54.95 
 
 		 231 aa  245  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3371  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.442318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6533  cell cycle transcriptional regulator CtrA  53.6 
 
 		 233 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1508  cell cycle transcriptional regulator ctrA  51.46 
 
 		 237 aa  244  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_004310  BR1599  cell cycle transcriptional regulator CtrA  54.05 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1542  cell cycle transcriptional regulator CtrA  54.05 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6127  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1399  two component transcriptional regulator  51.88 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1903  two component transcriptional regulator  54.05 
 
 		 237 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2621  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1279  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461363  normal  0.257738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0303  two component transcriptional regulator  54.05 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4854  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 231 aa  241  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0563  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 235 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.621979  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2529  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.15 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  52.7 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5319  cell cycle transcriptional regulator CtrA  51.56 
 
 		 233 aa  235  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983847 
 
 
-
 
NC_002978  WD0732  cell cycle transcriptional regulator  46.26 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  42.92 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  37.61 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 224 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1830  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 250 aa  161  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  38.91 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 799 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4096  two component transcriptional regulator  49.72 
 
 		 184 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0574  two component transcriptional regulator  35.6 
 
 		 250 aa  154  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.821306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1866  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  36.32 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 224 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 1629 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  42.27 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.91 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4025  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2151  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  36.32 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49180  two-component response regulator PhoP  35.91 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831037 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 225 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1679  transcriptional regulatory protein PhoP, putative  35.91 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3709  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.91 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4200  two-component response regulator PhoP  35.91 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 219 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 220 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2348  two component transcriptional regulator  37.16 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000162881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  35.75 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  37.73 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1643  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  35.91 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>