More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1279 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2621  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1279  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461363  normal  0.257738 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1903  two component transcriptional regulator  99.58 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1399  two component transcriptional regulator  87.03 
 
 		 239 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2505  two component transcriptional regulator  88.99 
 
 		 238 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791438  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1508  cell cycle transcriptional regulator ctrA  87.34 
 
 		 237 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2605  two component transcriptional regulator  80.36 
 
 		 233 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1019  cell cycle transcriptional regulator CtrA  77.73 
 
 		 233 aa  378  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.736916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3079  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.36 
 
 		 233 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3527  two component response regulator  78.95 
 
 		 233 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0303  two component transcriptional regulator  79.02 
 
 		 233 aa  378  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0824  response regulator receiver  77.45 
 
 		 233 aa  378  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3336  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.36 
 
 		 233 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.523001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0784  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.45 
 
 		 233 aa  378  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2174  two component transcriptional regulator  78.67 
 
 		 235 aa  374  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3946  two component transcriptional regulator  77.02 
 
 		 233 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26309  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5573  two component transcriptional regulator  77.02 
 
 		 233 aa  374  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3488  two component transcriptional regulator  78.22 
 
 		 233 aa  374  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.487721  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0747  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.45 
 
 		 233 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  0.934966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3622  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.6 
 
 		 233 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0114155  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1542  cell cycle transcriptional regulator CtrA  79.02 
 
 		 232 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1599  cell cycle transcriptional regulator CtrA  79.02 
 
 		 232 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2529  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.07 
 
 		 233 aa  370  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1569  two component transcriptional regulator  79.02 
 
 		 232 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2213  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  79.46 
 
 		 249 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  79.11 
 
 		 231 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0344  two component transcriptional regulator  79.46 
 
 		 233 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1822  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.97 
 
 		 233 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.077619  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6127  two component transcriptional regulator  76.96 
 
 		 233 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3912  two component transcriptional regulator  76.39 
 
 		 233 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4233  two component transcriptional regulator  77.68 
 
 		 233 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0736222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3672  winged helix family two component transcriptional regulator  76.39 
 
 		 233 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6533  cell cycle transcriptional regulator CtrA  77.23 
 
 		 233 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1026  two component transcriptional regulator  76.34 
 
 		 231 aa  364  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0525  transcriptional regulatory protein  77.23 
 
 		 233 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369528  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4854  two component transcriptional regulator  77.68 
 
 		 231 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3371  two component transcriptional regulator  77.23 
 
 		 233 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.442318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0563  two component transcriptional regulator  76.68 
 
 		 235 aa  363  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.621979  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5319  cell cycle transcriptional regulator CtrA  70.09 
 
 		 233 aa  338  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  67.86 
 
 		 239 aa  328  7e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4096  two component transcriptional regulator  81.01 
 
 		 184 aa  270  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0732  cell cycle transcriptional regulator  52.07 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  51.48 
 
 		 265 aa  234  6e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  51.48 
 
 		 266 aa  234  9e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1202  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.6 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0234  DNA-binding response regulator  40.32 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  42.99 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  40.18 
 
 		 224 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1830  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  39.91 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.74 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  40.62 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  39.73 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1810  DNA-binding response regulator  37.67 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0562957  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2348  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000162881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5125  two component response regulator  39.21 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>