More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0465 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0465  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3158  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.44 
 
 		 225 aa  330  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2732  two component transcriptional regulator  55.61 
 
 		 225 aa  265  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2540  response regulator receiver  50.88 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6736  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.523736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4882  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 224 aa  234  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6964  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.043471  normal  0.107802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3534  two-component system response regulator  47.3 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_002950  PG0720  DNA-binding response regulator  46.85 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4933  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.742602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2586  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4553  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 227 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.130056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1332  response regulator receiver  45.29 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3049  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1449  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5580  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  36.28 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1185  response regulator receiver  34.38 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 256 aa  144  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 799 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 240 aa  144  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1433  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  33.63 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  38.57 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.44 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  36 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.44 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2714  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.92 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  35.45 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  34.65 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.28 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0142  DNA-binding response regulator  35.43 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0482  response regulator  35.27 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0484  response regulator  35.27 
 
 		 229 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 242 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  138  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  34.38 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  34.38 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  34.38 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0702  DNA-binding response regulator  34.82 
 
 		 223 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 224 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 223 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0485  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.56 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0634  DNA-binding response regulator  34.82 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0608  DNA-binding response regulator  34.82 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.56 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3016  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0627  DNA-binding response regulator  34.82 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 243 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.34 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 652 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1192  DNA-binding response regulator  32.44 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00982401  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0540  DNA-binding response regulator  34.82 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0571  DNA-binding response regulator  34.82 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0985  DNA-binding response regulator CiaR  32.89 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.447626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  33.19 
 
 		 219 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4731  DNA-binding response regulator  34.82 
 
 		 223 aa  134  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  31.7 
 
 		 231 aa  134  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0381  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1810  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0562957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>