More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5993 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5993  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  463  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5762  two component transcriptional regulator  93.59 
 
 		 234 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120401  normal  0.403713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1821  response regulator receiver  75.11 
 
 		 235 aa  354  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2156  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.68 
 
 		 235 aa  354  5.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00956512  normal  0.0958311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1772  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.11 
 
 		 235 aa  353  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0520  two component transcriptional regulator  71.37 
 
 		 234 aa  343  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.224382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1803  two component transcriptional regulator  67.67 
 
 		 232 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782093  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  44.2 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 273 aa  158  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.18 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  39.48 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  41.96 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 406 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  45.5 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 246 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  39.82 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  39.21 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  35.02 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  38.1 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0449  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.376072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.75 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  42.41 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  40.36 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4346  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 384 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0299016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.44 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 218 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  40.09 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 233 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 234 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 243 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.73 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  36.71 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  36.94 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>