More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3009 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_3009  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.333093 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4752  response regulator  40.09 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  41.82 
 
 		 223 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  41.36 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1166  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 321 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1170  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 220 aa  169  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3613  lantibiotic biosynthesis DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.127001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3900  lantibiotic biosynthesis DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04120  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.15 
 
 		 220 aa  168  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.745463 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3809  putative lantibiotic biosynthesis DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 220 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  37.89 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  38.39 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  38.33 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.72 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  38.39 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  41.23 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  40.79 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0925  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 219 aa  161  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000502161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  41.78 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.71 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0923  two-component response regulator; MrsR2 protein  36.32 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.227452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0906  response regulator  36.32 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  37.34 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 232 aa  158  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 230 aa  157  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  39.38 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>