More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0031 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0031  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0022  two component transcriptional regulator  98.67 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0040  two component transcriptional regulator  97.77 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0049  two component transcriptional regulator  97.33 
 
 		 225 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0030  two component transcriptional regulator  97.77 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0032  two component transcriptional regulator  95.96 
 
 		 225 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2676  DNA-binding response regulator  84 
 
 		 225 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0042  DNA-binding response regulator  84 
 
 		 225 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3276  DNA-binding response regulator  84 
 
 		 225 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0255  DNA-binding response regulator  84 
 
 		 225 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0039  DNA-binding response regulator  84 
 
 		 225 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2701  DNA-binding response regulator  84 
 
 		 225 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0042  DNA-binding response regulator  84 
 
 		 225 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1851  DNA-binding response regulator  84 
 
 		 225 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4040  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.91 
 
 		 232 aa  310  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.74 
 
 		 226 aa  262  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.74 
 
 		 226 aa  262  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.01 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  57.01 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  56.11 
 
 		 237 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3392  response regulator transcription regulator protein  57.14 
 
 		 224 aa  255  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.95 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.95 
 
 		 222 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  50.22 
 
 		 267 aa  204  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  49.78 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  48.64 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  49.78 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  49.78 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  49.78 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  49.78 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  49.78 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  47.75 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  47.3 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 222 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.61 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3084  transcriptional regulator TctD  48.17 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  48.17 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2981  transcriptional regulator TctD  48.17 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.510212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2928  transcriptional regulatory protein TctD  48.17 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2964  transcriptional regulator TctD  48.17 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  47.75 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  46.61 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 225 aa  188  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1045  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0254823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2580  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2935  putative response regulator transcription regulator protein  45.29 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2865  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3212  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3332  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  43.58 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1736  two-component response regulator transcription regulator protein  48.18 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.04 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  43.3 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  44.95 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.75 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  44.5 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.37 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 260 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 282 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 282 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1450  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  39.63 
 
 		 227 aa  165  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  44.95 
 
 		 247 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>