More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1461 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  91.55 
 
 		 142 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  76.98 
 
 		 143 aa  217  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  44.63 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  38.57 
 
 		 175 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  38.57 
 
 		 175 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  40.16 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  40.44 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  32.41 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  35.88 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  30.94 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  33.58 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  32 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  33.91 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 403 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 392 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1169  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2306  histidine kinase  26.67 
 
 		 479 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.808548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0607  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 129 aa  57  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000161034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  31.3 
 
 		 209 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1791 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  31.3 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1849  response regulator receiver domain-containing protein  32.28 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  25.62 
 
 		 497 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 		 863 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.82 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  27.66 
 
 		 1014 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.27 
 
 		 937 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.58 
 
 		 737 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03380  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.77 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.11 
 
 		 1316 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  27.64 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0699  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.05 
 
 		 246 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 		 653 aa  52.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.42 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.37 
 
 		 224 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  24.39 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25620  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.62 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.5 
 
 		 1245 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1121  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864132  normal  0.872256 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  27.05 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4295  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  23.58 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.48 
 
 		 204 aa  50.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.57 
 
 		 217 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 220 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 925 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 198 aa  50.1  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1975  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1003 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  28.29 
 
 		 785 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0332  C4-dicarboxylate transport response regulator transcription regulator protein  29.91 
 
 		 438 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 846 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  30.58 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  29.59 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1002 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  28.77 
 
 		 785 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  28.77 
 
 		 785 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  26.23 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 947 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4506  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  26.23 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3288  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1032 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1951  putative nitrate/nitrite response regulator; NarL  38.89 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120802  normal  0.965323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 802 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  30.37 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  30 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.32 
 
 		 941 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  30.37 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>