More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3611 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3611  response regulator receiver protein  100 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194602  normal  0.24428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.5 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 223 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.61 
 
 		 217 aa  98.6  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.68 
 
 		 211 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.9 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 224 aa  97.1  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.32 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.59 
 
 		 224 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 212 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  35.03 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.26 
 
 		 247 aa  95.9  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 220 aa  95.5  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 		 225 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  34.57 
 
 		 207 aa  95.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.99 
 
 		 216 aa  95.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  31.63 
 
 		 219 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  32.49 
 
 		 235 aa  95.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  32.12 
 
 		 212 aa  94.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 212 aa  94.4  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  32.64 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  29.08 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  29.08 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.63 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 207 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.73 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  34.01 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.68 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.84 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.36 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 		 226 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 209 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 		 209 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 213 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  30.05 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.21 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 209 aa  91.7  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.16 
 
 		 229 aa  91.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  29.08 
 
 		 214 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  33.51 
 
 		 213 aa  91.3  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.79 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 208 aa  90.9  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 236 aa  91.3  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  27.18 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  32.83 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.37 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  27.18 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 226 aa  90.5  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.84 
 
 		 228 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  27.18 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  27.18 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2343  two component LuxR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999882  normal  0.0841394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  31 
 
 		 223 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.84 
 
 		 219 aa  89.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 232 aa  89.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  27.18 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  27.18 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  33.33 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 250 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  28.87 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 236 aa  89.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 213 aa  89  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.51 
 
 		 230 aa  89.4  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  30.77 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>