More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4742 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4742  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  273  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  44 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  48.31 
 
 		 131 aa  121  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 136 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 131 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  46.49 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  43.1 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0607  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 129 aa  97.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000161034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  32.74 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  30.47 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  30.47 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.09 
 
 		 737 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  26.27 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0094  two component LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  27.91 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  32.73 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  32.73 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  32.73 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  32.73 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0745  two-component regulator  27.97 
 
 		 223 aa  51.6  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.802142  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  30 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  30 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  30 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5997  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4432  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1693  two-component regulator  27.97 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000232098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 		 1149 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  34.58 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 		 1155 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 		 1155 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3743  two component LuxR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 225 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  27.12 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 		 1155 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0762  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.218112  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0980  response regulator receiver domain-containing protein  27.97 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000790444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.13 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  25.42 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  29.37 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 213 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 226 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 		 223 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11120  Response regulator, sigma54-dependent regulatory protein; AlgB  27.2 
 
 		 448 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 210 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  29.75 
 
 		 234 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1538  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.705917  normal  0.0786085 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  29.75 
 
 		 234 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 221 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  27.97 
 
 		 223 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  29.75 
 
 		 234 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  29.75 
 
 		 234 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  29.75 
 
 		 234 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1992  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108622  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 215 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  33.33 
 
 		 226 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0113  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.272243  hitchhiker  0.000410564 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  27.73 
 
 		 232 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.23 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1159 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 368 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2541  nitrogen regulation protein NR(I)  34.52 
 
 		 470 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0985  DNA-binding response regulator CiaR  25.22 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.447626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0235  response regulator receiver  24.58 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  32.47 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1037 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  29.75 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  27.34 
 
 		 229 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3124  transcriptional regulatory protein QseB  33.8 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5989  response regulator receiver protein  35 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 229 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  29.75 
 
 		 234 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  29.75 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 403 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 220 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.27 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>