94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2734 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2734  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  265  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3861  response regulator receiver protein  56.78 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1810  response regulator receiver protein  58.62 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0923  response regulator receiver protein  61.02 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0033  response regulator receiver protein  57.63 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.315681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0882  response regulator receiver domain-containing protein  59.32 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489217  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3508  response regulator receiver protein  55.08 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2831  response regulator receiver protein  55.08 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4107  response regulator receiver protein  58.62 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0607  response regulator receiver domain-containing protein  56.78 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000161034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2901  putative transcription regulator protein  57.02 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2455  response regulator receiver domain-containing protein  53.39 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275006  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6326  response regulator receiver protein  58.47 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3994  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73116  normal  0.876977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1259  response regulator receiver protein  49.19 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3636  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1872  response regulator receiver domain-containing protein  54.31 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4742  response regulator receiver domain-containing protein  47.46 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0398  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0475  response regulator receiver protein  44.8 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2236  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5997  response regulator receiver protein  38.78 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1245  DNA-binding response regulator,, putative  37.01 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.841287  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0091  response regulator receiver domain-containing protein  35.14 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5989  response regulator receiver protein  38.55 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0122  response regulator receiver  36.28 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.940533  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1088  response regulator receiver domain-containing protein  32.74 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0944  response regulator receiver domain-containing protein  32.74 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2655  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.822475  normal  0.523205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1461  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.9 
 
 		 737 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1635  response regulator  36.36 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1553  response regulator  36.36 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1664  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0208755  normal  0.0661696 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0128  response regulator  36.36 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.450595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0291  putative transcription regulator protein  34.78 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4264  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0144  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5998  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0152  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4356  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4011  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4239  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0791  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.958147 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3765  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238428  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.43 
 
 		 403 aa  48.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5812  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.113001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0293  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 222 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1507  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  40 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 213 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0306  two component Fis family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.0618542 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0741  response regulator receiver protein  28.43 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.289134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2092  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 462 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0324  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.36 
 
 		 465 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.266606  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0313  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.36 
 
 		 465 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0494225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02260  Response regulator, LuxR family (CheY, HTH domains)  29.51 
 
 		 222 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 262 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  32.18 
 
 		 793 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4341  two component LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 343 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0475  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 453 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4041  response regulator receiver protein  29.25 
 
 		 127 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 215 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 210 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4890  two component Fis family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993283  decreased coverage  0.000990624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1595  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.89 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.356259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4377  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 237 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.19 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1834  response regulator receiver protein  30.49 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2387  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 510 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0745  two-component regulator  25.45 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.802142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.05 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.96 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 508 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4070  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  35.05 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.89 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 216 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2059  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  32.74 
 
 		 528 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0914415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0083  two component LuxR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.85 
 
 		 224 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 768 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  27.27 
 
 		 233 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  25.86 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 218 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3669  response regulator receiver protein  29.25 
 
 		 127 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 222 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>